Fondée le 8 septembre 2015 par ses 12 membres, l'Association jurassienne des étudiants en médecine est née sur l'idée originale de Baptiste Crelier et Valentin Simonin. Un Ajoulot et un Prévôtois qui ont l'inspiration un peu folle de mettre en place un Hôpital des Nounours dans le petit canton du Jura. Afin de satisfaire leurs ambitions, ils commencent à recruter leurs connaissances. De fil en aiguille, le projet prend de l'ampleur et le petit groupe se rend rapidement compte qu'ils ont besoin d'une structure. S'ensuit la fondation de l'AJEM avec Baptiste comme président et Valentin comme vice-président, bientôt rejoints par Léo Franchetti en tant que secrétaire. Il est logique d'associer l'AJEM avec l'Hôpital des Nounours, véritable force de l'association. Malgré tout, elle s'est très vite diversifiée avec de nombreuses autres activités.